Foi descoberto que as proteínas específicas e não-específicas, ligadas ao ARN, são fundamentalmente semelhantes


Investigadores da Faculdade da Medicina da Universidade Case Western Reserve (EUA) descobriram inesperadas semelhanças entre proteínas que se pensava serem fundamentalmente diferentes.
A equipa estudou como as proteínas se ligam ao ARN, um processo necessário para a expressão do gene. É sabido que algumas proteínas ligam apenas ARNs com determinadas sequências. Outras proteínas têm sido consideradas "não-específicas" porque elas interagem com ARNs em locais aparentemente aleatórios. Mas a equipa de Case Western Reserve publicou um novo estudo em Nature, mostrando que as proteínas não-específicas na verdade têm a capacidade de se tornarem específicas onde se ligam ao ARN - procurando e vinculando-se com sequências específicas de nucleótidos.
 
"Parece não haver coisa como proteínas específicas ou não-específicas; em essência, são todas específicas. Mas usam sua especificidade de maneira diferente," disse o Dr. Eckhard Jankowsky, coautor e professor no Centro de Biologia Molecular ARN na Faculdade de Medicina. "As nossas descobertas adiantam a compreensão de como as proteínas e os ácidos nucleicos controlam a expressão gênica, que leva ao conhecimento sobre como este controle é perdido ou alterado em casos de cancro, infeções virais e outras doenças."
 
A equipa de investigação de Case Western Reserve desenvolveu um novo método para medir as proteínas que se ligam a milhares de diferentes moléculas de ARN, denominado High Throughput Sequencing Kinetics (HITS-KIN). Aplicável a muitos domínios biológicos, a abordagem permite aos investigadores analisar um grande número de mutações nos sítios do ADN ou ARN de ligação das proteínas, rapidamente. O HITS-KIN permite aos cientistas completar experiências em dias, que anteriormente teriam levado anos para terminar.
 
"Através da combinação de métodos bioquímicos tradicionais com a tecnologia de sequenciamento da última geração, podemos agora fazer uma experiência com milhares de ARNs diferentes, enquanto antes estávamos limitados a analisar apenas uma molécula de ARN, de cada vez," disse o Dr. Michael E. Harris, coautor e professor adjunto de Bioquímica na Faculdade de Medicina.
 
Os defeitos nas interações entre o ARN e as proteínas ligadas subjazem inúmeras doenças humanas, incluindo o cancro e as doenças neurodegenerativas. Este conhecimento de como as moléculas interagem é um passo fundamental para o desenvolvimento de novas estratégias para o tratamento de doenças humanas.
 
"As novas descobertas dos investigadores de Case Western Reserve podem sugerir formas de projetar medicamentos visando toda uma classe de proteínas que se ligam ao ADN e ARN em locais sem sequências de reconhecimento específico, que iria guiá-las ao lugar. Anteriormente, não percebíamos como é que estas proteínas reconheciam onde se ligar ao ADN ou ARN, o que dificultava a projeção de medicamentos visando essa atividade," disse o Dr. Oleg Barski, do Instituto Nacional de Ciências Médicas Gerais do Instituto Nacional de Saúde, que financiou parcialmente a investigação. "A investigação também mostra que a tecnologia de sequenciamento da próxima geração pode aprofundar a nossa compreensão destas proteínas e de como elas controlam o funcionamento interno das células."
 
Jankowsky e Harris utilizaram o HITS-KIN para analisar a fraqueza ou força de um grande número de diferentes ARNs se ligam a uma proteína em particular. Embora estivesse previsto que proteínas não-específicas se ligassem a sequências de ARN com afinidade semelhante, os investigadores encontraram a mesma ampla gama de afinidades de ligação para a proteína não-específica que normalmente aparecem para uma proteína específica.
 
Os autores teorizam que os dois tipos de proteínas podem não diferir fundamentalmente, mas que usam partes diferentes de seu espetro de afinidade para expressar os genes corretamente. Enquanto as proteínas específicas podem se conectar com as suas sequências preferenciais entre muitas moléculas de ARN da célula, as sequências preferenciais de ARN das proteínas não-específicas não são criadas pela célula. Como resultado, as proteínas não-específicas são deixadas para ligar para os ARNs disponíveis com afinidades semelhantes a muitos ARNs diferentes.
 
"Essencialmente, cada proteína tem preferências de ligação. No entanto, as proteínas não-específica podem se ligar apenas às sequências que lhes são disponibilizadas, enquanto que as proteínas específicas são capazes de se ligar às sequências primeiramente escolhidas, "acrescentou Jankowsky.
 
Fonte: http://www.sciencedaily.com/releases/2013/10/131008112412.htm

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